Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PVALBP20472 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PVALBP20472 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PVALBP20472 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PVALBP20472 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PVALBP20472 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PVALBP20472 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PVALBP20472 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PVALBP20472 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PVALBP20472 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PVALBP20472 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PVALBP20472 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PVALBP20472 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PVALBP20472 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PVALBP20472 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PVALBP20472 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PVALBP20472 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PVALBP20472 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PVALBP20472 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PVALBP20472 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PVALBP20472 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PVALBP20472 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms