Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RAB4AP20338 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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RAB4AP20338 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RAB4AP20338 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RAB4AP20338 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RAB4AP20338 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RAB4AP20338 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB4AP20338 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB4AP20338 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB4AP20338 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB4AP20338 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB4AP20338 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RAB4AP20338 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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