Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD33P20138 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD33P20138 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD33P20138 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD33P20138 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD33P20138 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD33P20138 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD33P20138 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD33P20138 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD33P20138 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms