Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B1P20020 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP2B1P20020 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms