Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms