Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCLP19338 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCLP19338 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
NCLP19338 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCLP19338 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCLP19338 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCLP19338 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCLP19338 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms