Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DESP17661 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DESP17661 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DESP17661 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DESP17661 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DESP17661 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms