Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CAPN2P17655 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms