Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HOXB4P17483 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB4P17483 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms