Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms