Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCFC2P16383 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCFC2P16383 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms