Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ITGB4P16144 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGB4P16144 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms