Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CD44P16070 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CD44P16070 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CD44P16070 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CD44P16070 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CD44P16070 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms