Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RLBP1P12271 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms