Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL11A1P12107 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms