Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT3P12035 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT3P12035 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT3P12035 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT3P12035 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRT3P12035 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT3P12035 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT3P12035 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT3P12035 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT3P12035 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT3P12035 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT3P12035 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT3P12035 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT3P12035 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT3P12035 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms