Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TOP2AP11388 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
TOP2AP11388 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TOP2AP11388 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms