Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHGAP10645 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHGAP10645 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHGAP10645 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHGAP10645 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHGAP10645 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHGAP10645 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHGAP10645 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHGAP10645 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHGAP10645 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHGAP10645 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHGAP10645 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHGAP10645 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms