Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIGD3P0DMS9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms