Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRCP08575 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRCP08575 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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