Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RHOP08100 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RHOP08100 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RHOP08100 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RHOP08100 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RHOP08100 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RHOP08100 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms