Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFNA4P05014 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms