Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYCNP04198 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYCNP04198 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYCNP04198 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AL392088.1-201ENST00000428364 670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms