Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
VAPBO95292 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAPBO95292 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
VAPBO95292 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
VAPBO95292 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VAPBO95292 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VAPBO95292 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms