Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PDE8BO95263 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE8BO95263 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms