Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F6O75461 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F6O75461 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F6O75461 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F6O75461 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F6O75461 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F6O75461 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F6O75461 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F6O75461 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms