Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPFIA4O75335 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms