Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARCH6O60337 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCH6O60337 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms