Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRKAB2O43741 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRKAB2O43741 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms