Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FANCAO15360 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
FANCAO15360 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FANCAO15360 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FANCAO15360 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FANCAO15360 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FANCAO15360 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FANCAO15360 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCAO15360 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCAO15360 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCAO15360 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCAO15360 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCAO15360 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCAO15360 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCAO15360 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FANCAO15360 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
FANCAO15360 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCAO15360 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCAO15360 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCAO15360 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCAO15360 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCAO15360 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCAO15360 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCAO15360 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCAO15360 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FANCAO15360 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms