Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GNPATO15228 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPATO15228 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPATO15228 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPATO15228 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPATO15228 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPATO15228 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPATO15228 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPATO15228 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPATO15228 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPATO15228 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GNPATO15228 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GNPATO15228 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GNPATO15228 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GNPATO15228 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GNPATO15228 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GNPATO15228 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GNPATO15228 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GNPATO15228 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms