Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ANKRD28O15084 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms