Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

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Length 1,643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM6BO15054 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM6BO15054 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM6BO15054 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM6BO15054 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM6BO15054 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM6BO15054 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
KDM6BO15054 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
KDM6BO15054 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDM6BO15054 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
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