Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A2O14975 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC27A2O14975 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms