Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIEO00221 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms