Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN34H7C241 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms