Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
H7C1D1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H7C1D1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H7C1D1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H7C1D1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H7C1D1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
H7C1D1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
H7C1D1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C1D1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C1D1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C1D1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C1D1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C1D1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C1D1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C1D1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C1D1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C1D1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C1D1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
H7C1D1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
H7C1D1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H7C1D1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
H7C1D1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms