Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IDSB3KWA1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms