Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RGPD3A6NKT7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms