Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FOXQ1Q9C009 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FOXQ1Q9C009 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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