Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ANKRD42Q8N9B4 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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