Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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FOXE3Q13461 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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FOXE3Q13461 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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FOXE3Q13461 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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