Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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IFT88Q13099 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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IFT88Q13099 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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