Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC114488.2-222ENST00000445166 362 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CRNDE-214ENST00000637011 865 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OR7E161P-202ENST00000641994 1033 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZNF43-201ENST00000354959 2881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 DOCK5-201ENST00000276440 10075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 THSD4-AS1-202ENST00000562634 2182 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 PGAP2-210ENST00000464441 699 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
MKRN3Q13064 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
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