Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHRNEQ04844 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms