Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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