Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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COL4A6Q14031 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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COL4A6Q14031 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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COL4A6Q14031 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL4A6Q14031 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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