Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRCP08575 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTPRCP08575 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
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