Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
CTF1Q16619 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTF1Q16619 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
CTF1Q16619 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
CTF1Q16619 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CTF1Q16619 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CTF1Q16619 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
CTF1Q16619 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CTF1Q16619 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 CLCN3P1-201ENST00000423965 1017 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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CTF1Q16619 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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CTF1Q16619 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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CTF1Q16619 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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CTF1Q16619 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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CTF1Q16619 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
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CTF1Q16619 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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CTF1Q16619 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CTF1Q16619 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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