Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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